30 июня 2020 г. в Республике Казахстан был официально открыт филиал МИЦАИ, расположенный в городе Алматы. Директором филиала назначен Нурбол Баймуханов. Основная функция филиала заключается в представлении интересов института и их защите на территории Республики Казахстан. На данный момент продолжаются переговоры по получению филиалом дипломатического статуса в Казахстане.
Филиал МИЦАИ в г. Алматы активно ведет свои деятельность, но до сих пор не получил дипломатического статуса. На данный момент предпринимаются следующие шаги для получения аккредитации:
• ведутся переговоры с представителями МИД РК;
• ожидается встреча с представителями Администрации президента РК.
Несмотря на отсутствие финансирования, в филиале проводится научно-исследовательская работа силами Нурбола Баймуханова-директора филиала. Он занимается открытием городища в Восточном Казахстане, вопросами северных маршрутов Великого шелкового пути. Кроме того, проводятся антропологические исследования, основанные на полученных образцах ДНК.